101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0073 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 352 aa  734    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  73.86 
 
 		 351 aa  548  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  72.16 
 
 		 351 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  57.49 
 
 		 344 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  49.15 
 
 		 351 aa  356  3.9999999999999996e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  47.69 
 
 		 358 aa  308  8e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  48.16 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  48.85 
 
 		 320 aa  302  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  48.08 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  47.56 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  48.02 
 
 		 327 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  47.77 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  47.85 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  48.18 
 
 		 310 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  49.68 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  46.93 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  48.18 
 
 		 319 aa  286  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  48.34 
 
 		 321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  47.12 
 
 		 318 aa  282  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  47.18 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  48.15 
 
 		 308 aa  279  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  47.08 
 
 		 311 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  47.35 
 
 		 320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  46.34 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  45.28 
 
 		 316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  44.81 
 
 		 314 aa  272  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  44.81 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  43.65 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  47.52 
 
 		 310 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  45.17 
 
 		 314 aa  269  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  44.06 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  45.51 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  41.64 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  43.24 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  44.87 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  42.73 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  40.54 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  41.3 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  41.3 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  41.3 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  40.13 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  40.67 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  43.67 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 		 319 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 579 aa  59.7  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  26.99 
 
 		 595 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  27.68 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 348 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  24.5 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 345 aa  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 		 368 aa  49.7  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 800 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  26.11 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  26.37 
 
 		 391 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 		 471 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7035  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  24.72 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165617 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 1002 aa  46.2  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.44 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.61 
 
 		 455 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  27.59 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  35.53 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 1000 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  29.17 
 
 		 486 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  35.48 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 471 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  23.85 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0105  radical SAM oxidoreductase  24.43 
 
 		 386 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.77 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  27.4 
 
 		 445 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 459 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 516 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  25.3 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.13 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  31.63 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.94 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  26.14 
 
 		 382 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 327 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.14 
 
 		 464 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 481 aa  43.5  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.33 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 323 aa  43.1  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0017  MoaA/NifB/PqqE family protein  24.16 
 
 		 384 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.8 
 
 		 440 aa  42.7  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 		 348 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.29 
 
 		 308 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 396 aa  42.7  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 357 aa  42.7  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>