124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05035 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  740    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  48.56 
 
 		 351 aa  363  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  49.15 
 
 		 352 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  50 
 
 		 344 aa  349  5e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  47.7 
 
 		 351 aa  345  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  45.87 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  49.35 
 
 		 317 aa  315  9e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  45.6 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  47.25 
 
 		 319 aa  299  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  47.19 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  46.62 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  46.15 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  45.95 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  46.67 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  43.83 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  44.06 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  42.29 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  44.63 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  42.11 
 
 		 337 aa  272  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  43.23 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  41.56 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  44.48 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  41.3 
 
 		 337 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  45.28 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  43.85 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  43.22 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  44.44 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  43.09 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  42.72 
 
 		 310 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  42.41 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  43.04 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  42.95 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  44.24 
 
 		 332 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  40.79 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  45.48 
 
 		 329 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  45.48 
 
 		 329 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  41.77 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  43.52 
 
 		 335 aa  242  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  41.39 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  41.82 
 
 		 324 aa  238  9e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  37.93 
 
 		 341 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  39.52 
 
 		 319 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  43.08 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  37.74 
 
 		 319 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 800 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  32.98 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  25.33 
 
 		 595 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  26.12 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  20.41 
 
 		 579 aa  56.6  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  25.17 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23060  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  28.4 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.1711 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  34.74 
 
 		 389 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  34.74 
 
 		 377 aa  52.8  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  22.52 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0897  radical SAM family protein  25.56 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.66 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0146  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0792983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  22.58 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  26.47 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 466 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.78 
 
 		 479 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6662  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  26.09 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  31.62 
 
 		 479 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 501 aa  47.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6192  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 460 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  21.13 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0390  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 331 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000824452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 471 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 1000 aa  46.2  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  32.88 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3047  radical SAM family protein  23.48 
 
 		 153 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.62 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.59 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1699  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.440195  hitchhiker  0.000169379 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  29.33 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  31.46 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>