286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0146 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0146  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0792983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  35.2 
 
 
330 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 
328 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  31.79 
 
 
314 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  32.78 
 
 
595 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  34.49 
 
 
579 aa  119  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  33.33 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
1000 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  29.8 
 
 
1014 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 
1005 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 
427 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  35.57 
 
 
561 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  31.51 
 
 
375 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 
1002 aa  62.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  29.68 
 
 
379 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 
1039 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 
405 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  33.56 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
800 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
368 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
410 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 
337 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28 
 
 
479 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  29.93 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  32.59 
 
 
429 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  33.56 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  29.24 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 
496 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.57 
 
 
373 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 
415 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  27.72 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.5 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 
396 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 
409 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 
366 aa  55.8  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.94 
 
 
329 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0060  radical SAM family protein  34.06 
 
 
387 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.11 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 
414 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 
396 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  33.11 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  32.19 
 
 
412 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0897  radical SAM family protein  23.74 
 
 
380 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  23.89 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.47 
 
 
365 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  31.69 
 
 
391 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  32.67 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 
459 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.16 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.88 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 
405 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 
363 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.66 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 
359 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3524  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.68 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 
501 aa  53.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.83 
 
 
337 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 
378 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 
316 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.47 
 
 
337 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
380 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 
395 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
323 aa  52.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 
364 aa  52.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.77 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.47 
 
 
337 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  28.22 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.47 
 
 
337 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
405 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.47 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.47 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.47 
 
 
337 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.49 
 
 
326 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.47 
 
 
337 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.28 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.761201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.74 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 
453 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 
446 aa  50.8  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  22.81 
 
 
363 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  30 
 
 
409 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 
446 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.7 
 
 
397 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  32.89 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 
480 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  32.89 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0101  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.34 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.012034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3065  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.22 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  22.56 
 
 
429 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>