More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5883 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 332 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  67.67 
 
 		 330 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  35.71 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0146  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0792983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 1002 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  33.12 
 
 		 516 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 496 aa  75.9  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  31.03 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 579 aa  73.2  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  31.95 
 
 		 1005 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  33.88 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  33.72 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 395 aa  67  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  29.73 
 
 		 1014 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  35.17 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  35.76 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  31.45 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.2 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.27 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.134726  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.84 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.51 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  32.32 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  27.51 
 
 		 1000 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  31.13 
 
 		 595 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  27.62 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2680  radical SAM family protein  31.87 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  34.65 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.72 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.49 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.49 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.58 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.64 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 429 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2971  hypothetical protein  32.04 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0553904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  22.33 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  31.21 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.75 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.01 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.6 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  31.41 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  34.46 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.68 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2267  Fe-S oxidoreductase  30.94 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  32.08 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  26.53 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.14 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  25.17 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  28.64 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  29.49 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.46 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  32.28 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2293  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.14 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2952  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.06 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2335  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.14 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.74 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 800 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  27.52 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>