181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2548 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  59.34 
 
 		 595 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  53.29 
 
 		 314 aa  335  9e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  53.14 
 
 		 330 aa  325  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  50.17 
 
 		 579 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0146  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0792983  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 1005 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  34 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  35.76 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  21.4 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 1000 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 396 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  32.11 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  29.71 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  23.72 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 1002 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01723  hypothetical protein  31.21 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.97 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  31.37 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  30.07 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  33.83 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 501 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 418 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 381 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 395 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  29.71 
 
 		 391 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  29.22 
 
 		 1014 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.33 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 417 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 496 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 468 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0900  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  29.08 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  31.78 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  24.18 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  27.23 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  30.66 
 
 		 405 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 398 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 365 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  27.04 
 
 		 379 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 800 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 329 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 329 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 		 348 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 		 394 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 391 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 327 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 414 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 391 aa  49.3  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  33.66 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0897  radical SAM family protein  27.04 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  24.48 
 
 		 491 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  31.33 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.71 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  24.54 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  27.39 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  28.68 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  34.65 
 
 		 210 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  25.33 
 
 		 776 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 401 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 459 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 1039 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>