139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0590 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  72.41 
 
 		 320 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  68.96 
 
 		 337 aa  474  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  66.25 
 
 		 322 aa  444  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  63.95 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  63.12 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  63.46 
 
 		 320 aa  421  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  62.42 
 
 		 319 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  58.66 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  63.75 
 
 		 317 aa  387  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  61.89 
 
 		 314 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  60.06 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  58.63 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  57.95 
 
 		 314 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  55.16 
 
 		 311 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  50.81 
 
 		 310 aa  338  9e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  52.61 
 
 		 310 aa  335  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  52.46 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  53.82 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  51.63 
 
 		 310 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  48.22 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  49.35 
 
 		 351 aa  315  8e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  51.99 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  50.99 
 
 		 314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  48.55 
 
 		 351 aa  311  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  50.16 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  47.56 
 
 		 352 aa  300  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  48.84 
 
 		 318 aa  291  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  48.03 
 
 		 337 aa  285  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  45.3 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  45.97 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  47.34 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  47.62 
 
 		 324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  45.18 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  44.63 
 
 		 318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  46.82 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  44.73 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  45.37 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  43.27 
 
 		 328 aa  257  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  40.72 
 
 		 316 aa  245  8e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  40.4 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  44.26 
 
 		 329 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  44.26 
 
 		 329 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  42.03 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  41.69 
 
 		 319 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  22.33 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.3 
 
 		 405 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 395 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  29.29 
 
 		 391 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  24.06 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 		 496 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  23.24 
 
 		 365 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 468 aa  50.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  25.66 
 
 		 401 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 401 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 401 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.62 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  21.01 
 
 		 497 aa  49.3  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 327 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.87 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 348 aa  49.3  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 422 aa  49.3  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.92 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  22.82 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  30.07 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 800 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.19 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.95 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.95 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  25.68 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.67 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 382 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 453 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  28.67 
 
 		 387 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 381 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 474 aa  46.6  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 364 aa  46.6  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 409 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 410 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 417 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>