67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2457 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  100 
 
 		 318 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  73.27 
 
 		 337 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  58.18 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  50.99 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  48.84 
 
 		 317 aa  291  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  48.16 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  46.13 
 
 		 329 aa  286  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  46.56 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  48.11 
 
 		 337 aa  282  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  45.34 
 
 		 351 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  43.57 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  46.36 
 
 		 314 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  46.69 
 
 		 314 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  47.67 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  49.01 
 
 		 317 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  45.51 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  45.67 
 
 		 310 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  45.12 
 
 		 358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  47.16 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  43.71 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  44.7 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  47.37 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  44.7 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  41.56 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  47.84 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  42.12 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  47.65 
 
 		 311 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  44.06 
 
 		 352 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  43.48 
 
 		 320 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  48.84 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  44.65 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  45.36 
 
 		 310 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  44.23 
 
 		 332 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  43.96 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  44.23 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  42.68 
 
 		 322 aa  255  8e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  43.09 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  44.11 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  42.41 
 
 		 329 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  42.41 
 
 		 329 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  42.49 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  42.42 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 		 316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  41.14 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  40.13 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  30.2 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 579 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  27.54 
 
 		 595 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 459 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 417 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 800 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  20.39 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 378 aa  46.6  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 395 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 537 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.23 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 401 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 401 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  25.81 
 
 		 401 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 498 aa  42.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  22.07 
 
 		 317 aa  42.4  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>