165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1591 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  720    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  57.73 
 
 
351 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  59.58 
 
 
351 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  57.49 
 
 
352 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  50 
 
 
351 aa  349  5e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  47.34 
 
 
327 aa  306  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  48.57 
 
 
338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  46.01 
 
 
329 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  45.82 
 
 
358 aa  296  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  46.77 
 
 
318 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  48.36 
 
 
308 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  44.81 
 
 
320 aa  285  5.999999999999999e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  47.02 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  45.3 
 
 
317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  44.34 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  43.85 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  45.14 
 
 
337 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  46.71 
 
 
319 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  43.57 
 
 
318 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  43.5 
 
 
332 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  46.18 
 
 
321 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  45.39 
 
 
314 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  43.41 
 
 
310 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  43.17 
 
 
314 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  45 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  45.48 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  45.75 
 
 
314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  42.78 
 
 
364 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  43.09 
 
 
310 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  45 
 
 
322 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  45.51 
 
 
320 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  43.09 
 
 
310 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  42.6 
 
 
337 aa  262  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  44.97 
 
 
317 aa  255  6e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  42.37 
 
 
328 aa  246  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  41.91 
 
 
341 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  40.2 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  40 
 
 
337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  43.3 
 
 
335 aa  242  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  40.84 
 
 
319 aa  238  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  39.88 
 
 
332 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  40.84 
 
 
319 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  40.88 
 
 
324 aa  228  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  40.71 
 
 
329 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  40.71 
 
 
329 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 
368 aa  59.7  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 
323 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
1000 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 
800 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.14 
 
 
365 aa  56.2  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 
466 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 
326 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 
429 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 
356 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 
319 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 
330 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 
1002 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
422 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.86 
 
 
330 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 
380 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2817  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 
340 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  31.51 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  28.57 
 
 
354 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.95 
 
 
298 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 
481 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.67 
 
 
391 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  22.99 
 
 
379 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  33.71 
 
 
486 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2079  MoaA/NifB/PqqE family Fe-S oxidoreductase  27.08 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  31.16 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 
1005 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 
579 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.41 
 
 
479 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 
462 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6662  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  25.87 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  31.93 
 
 
514 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 
514 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 
514 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 
482 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 
482 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  28.97 
 
 
372 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.22 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 
496 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  29.17 
 
 
366 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 
344 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23060  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.97 
 
 
334 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.1711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 
412 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.91 
 
 
339 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.11 
 
 
329 aa  46.6  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>