146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1335 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  100 
 
 
337 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  66.87 
 
 
328 aa  478  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  65.65 
 
 
332 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  68.11 
 
 
335 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  66.98 
 
 
324 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  65.71 
 
 
329 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  65.71 
 
 
329 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  50.63 
 
 
319 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  47.09 
 
 
364 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  47.96 
 
 
329 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  45.54 
 
 
327 aa  281  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  47.34 
 
 
317 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  48.4 
 
 
320 aa  279  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  47.71 
 
 
337 aa  271  9e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  47.92 
 
 
317 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  45.18 
 
 
319 aa  268  8e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  43.5 
 
 
358 aa  267  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  43.27 
 
 
310 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  44.65 
 
 
318 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 
318 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  44.94 
 
 
320 aa  262  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  46.15 
 
 
321 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  42.63 
 
 
310 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  45.54 
 
 
314 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  44.79 
 
 
322 aa  260  3e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  43.15 
 
 
332 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  46.5 
 
 
314 aa  259  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  44.52 
 
 
311 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  41.99 
 
 
310 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  43.23 
 
 
314 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  43.23 
 
 
314 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 
341 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  43.4 
 
 
308 aa  248  9e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 
351 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  42.31 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  40 
 
 
344 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  43.17 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  42.77 
 
 
351 aa  242  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  41.39 
 
 
351 aa  239  4e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  41.3 
 
 
352 aa  238  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  38.8 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  40 
 
 
338 aa  231  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  40.25 
 
 
335 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  37.94 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  37.34 
 
 
319 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  27.38 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.71 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  31.43 
 
 
391 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 
516 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 
395 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 
579 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 
378 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 
405 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
396 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 
399 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
412 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 
380 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 
399 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  27.38 
 
 
354 aa  52.8  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  45.07 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  27.65 
 
 
561 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 
800 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 
377 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 
496 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 
440 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.71 
 
 
401 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 
401 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 
401 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
418 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
460 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  20.54 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.41 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  27.45 
 
 
595 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 
396 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1415  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 
1000 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 
398 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 
463 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  35.44 
 
 
428 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 
327 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01723  hypothetical protein  28.03 
 
 
375 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 
328 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 
363 aa  46.2  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.41 
 
 
367 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 
405 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0537  hypothetical protein  30.21 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0408  hypothetical protein  30.21 
 
 
375 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>