More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2817 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2817  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 340 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.77 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 		 396 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  29.73 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  30.49 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  30.1 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  27.41 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  32.65 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  27.4 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 		 428 aa  79.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  30.96 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  24.03 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  33.72 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  26.01 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.95 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 446 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 565 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4243  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  31.95 
 
 		 413 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  24.24 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  31.34 
 
 		 487 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0897  radical SAM family protein  29.94 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  29.94 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.42 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 466 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.49 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  23.51 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 496 aa  66.2  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.83 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0883  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.24 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.03 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4646  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  22.03 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.18 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.31 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.25 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  22.37 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  22.71 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  22.81 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  25.27 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  23.99 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.63 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.07 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  25.21 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  27.5 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  22.84 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  27.86 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7439  Fe-S oxidoreductase-like protein  30.06 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.28 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.46 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0354  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.880417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>