128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1763 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 319 aa  657    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  68.54 
 
 		 321 aa  447  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  65.2 
 
 		 319 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  62.42 
 
 		 317 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  62.09 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  60.82 
 
 		 320 aa  388  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  56.23 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  59.09 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  60.91 
 
 		 317 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  55.48 
 
 		 320 aa  357  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  59.03 
 
 		 314 aa  344  1e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  52.66 
 
 		 322 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  51.75 
 
 		 314 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  52.13 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  48.86 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  49.51 
 
 		 310 aa  322  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  50.96 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  49.19 
 
 		 310 aa  319  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  49.19 
 
 		 310 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  52.61 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  51.03 
 
 		 364 aa  312  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  51.8 
 
 		 308 aa  298  9e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  50.99 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  49.03 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  50.63 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  49.67 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  49.68 
 
 		 352 aa  288  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  46.71 
 
 		 344 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  49.17 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  46.96 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  48.57 
 
 		 324 aa  278  8e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  44.63 
 
 		 351 aa  276  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  46.41 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  47.1 
 
 		 351 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  43.63 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  45.45 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  44.73 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  44.55 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  42.21 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  44.22 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  44.22 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  43.42 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  41.28 
 
 		 319 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  41.28 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  35.21 
 
 		 800 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  28.85 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  31.29 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 579 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 480 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 496 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  33.12 
 
 		 529 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  39.32 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 		 429 aa  50.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 565 aa  49.7  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  21.74 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 422 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.85 
 
 		 399 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.35 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.77 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  29.37 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 		 537 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 498 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3375  radical SAM family protein  36 
 
 		 640 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.38 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 468 aa  47  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 		 394 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.76 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.78 
 
 		 397 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  22.6 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  38.27 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 366 aa  45.8  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  28.47 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>