117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1988 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  100 
 
 		 328 aa  677    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  70.81 
 
 		 335 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  69.78 
 
 		 332 aa  481  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  66.87 
 
 		 337 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  69.03 
 
 		 329 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  69.03 
 
 		 329 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  63.55 
 
 		 324 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  46.75 
 
 		 329 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  46.33 
 
 		 322 aa  278  8e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  45.69 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  41.37 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  46.01 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 		 327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  41.9 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  44.73 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  43.63 
 
 		 319 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  43.56 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  42.59 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  44.59 
 
 		 311 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  42.69 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  43.27 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  43.03 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  43.21 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  43.71 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  42.33 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  43.45 
 
 		 319 aa  255  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  44.27 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  43.09 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  44.81 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  45.05 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  44.87 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  44.13 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  42.95 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  42.55 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  42.73 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  42.37 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  43.59 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  43.83 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  38.77 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  38.61 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  43.08 
 
 		 351 aa  231  9e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  37.35 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  35.96 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  35.96 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.54 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  26.51 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 		 1005 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  29.55 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 579 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  21.97 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.37 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 427 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 396 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  28.03 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  22.55 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  30.94 
 
 		 800 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  21.56 
 
 		 422 aa  50.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  44.93 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 412 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 415 aa  50.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 		 395 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.17 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 380 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 1002 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  27.95 
 
 		 561 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 460 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  26 
 
 		 595 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 518 aa  46.6  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  21.48 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  20.66 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.88 
 
 		 394 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.08 
 
 		 397 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 		 428 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 565 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 1000 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>