134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_13341 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 332 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  65.05 
 
 		 314 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  65.61 
 
 		 317 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  60.06 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  57.84 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  58.14 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  60.06 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  58.33 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  59.49 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  54.9 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  57.32 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  59.09 
 
 		 319 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  55.45 
 
 		 322 aa  346  4e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  53.72 
 
 		 320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  50.65 
 
 		 310 aa  335  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  49.51 
 
 		 310 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  51.82 
 
 		 329 aa  332  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  50 
 
 		 310 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  50.65 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  52.96 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  46.78 
 
 		 364 aa  308  9e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  48.85 
 
 		 314 aa  296  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  43.5 
 
 		 344 aa  278  6e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  47.37 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  43.98 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  44.11 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  47.19 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  45.1 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  43.15 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  44.55 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  42.95 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  43.79 
 
 		 318 aa  251  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  42.9 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  43.23 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  40.2 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  40.54 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  38.77 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  40.94 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  41.03 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  41.03 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  40.89 
 
 		 324 aa  232  7.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  42.49 
 
 		 341 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  41.75 
 
 		 319 aa  231  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  41.08 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  38.83 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 800 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  27.81 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 468 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 417 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  27.81 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 		 459 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  22.42 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 480 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  30.94 
 
 		 415 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.94 
 
 		 401 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.94 
 
 		 401 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.94 
 
 		 401 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 429 aa  49.7  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1695  tungsten-containing aldehyde ferredoxin oxidoreductase cofactor modifying protein  33.33 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 579 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.81 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  29.2 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 		 565 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0257  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.58 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.862128  normal  0.0494726 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.19 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  30.34 
 
 		 561 aa  47  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  20.71 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 389 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 358 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  31.31 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 537 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  27.7 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 608 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 		 411 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 		 395 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  28.15 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 344 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 496 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>