169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1695 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1695  tungsten-containing aldehyde ferredoxin oxidoreductase cofactor modifying protein  100 
 
 
291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  32.74 
 
 
344 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  33.22 
 
 
497 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3165  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 
343 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
418 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 
330 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.17 
 
 
769 aa  82.8  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.55 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.25 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  25.17 
 
 
561 aa  75.9  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.42 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 
429 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.51 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.21 
 
 
379 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 
414 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  23.96 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.09 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  23.93 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  24.28 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
384 aa  67  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  24.33 
 
 
401 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 
401 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 
401 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.77 
 
 
397 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.09 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 
391 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.32 
 
 
422 aa  63.2  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  22.73 
 
 
346 aa  62.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 
333 aa  62.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 
381 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 
429 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 
363 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 
393 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  21.64 
 
 
501 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  24.82 
 
 
383 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 
428 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.27 
 
 
375 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 
347 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 
390 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  36.96 
 
 
468 aa  59.7  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 
377 aa  59.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  25 
 
 
396 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  36.46 
 
 
407 aa  58.9  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  23.89 
 
 
510 aa  58.9  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
389 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  25.59 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  26.09 
 
 
381 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.49 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 
480 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 
382 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 
381 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  21.5 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 
356 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 
405 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 
359 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 
395 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  22.82 
 
 
491 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.53 
 
 
380 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
405 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 
409 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.91 
 
 
399 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 
394 aa  53.1  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 
323 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 
336 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 
404 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.77 
 
 
384 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  24.85 
 
 
354 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.44 
 
 
379 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  22.15 
 
 
366 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 
376 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
412 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 
296 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 
394 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.52 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>