More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0911 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 497 aa  1026    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  45.13 
 
 		 344 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1695  tungsten-containing aldehyde ferredoxin oxidoreductase cofactor modifying protein  33.22 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 330 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.33 
 
 		 349 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 377 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.69 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25 
 
 		 346 aa  114  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 325 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  24.39 
 
 		 330 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 363 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 358 aa  113  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0808  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 359 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.41 
 
 		 479 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 332 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 501 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 327 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  22.1 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3165  Radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 380 aa  100  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 389 aa  100  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.86 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  21.82 
 
 		 356 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 429 aa  97.8  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 423 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  21.82 
 
 		 358 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  21.82 
 
 		 358 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.21 
 
 		 397 aa  95.9  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 414 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 361 aa  93.6  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 418 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 372 aa  93.2  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4157  radical SAM superfamily protein  28.7 
 
 		 356 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  22.12 
 
 		 333 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  22.16 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.04 
 
 		 561 aa  91.3  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.16 
 
 		 397 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.16 
 
 		 347 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 		 359 aa  90.1  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 399 aa  90.1  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.95 
 
 		 371 aa  90.1  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  23.46 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 342 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 380 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 384 aa  89  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  22.86 
 
 		 363 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 462 aa  87.8  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  24.5 
 
 		 422 aa  87  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.29 
 
 		 378 aa  87  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 364 aa  86.7  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  24.37 
 
 		 769 aa  86.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  24.86 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  23.67 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2450  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.702172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  24.05 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  25.66 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  24.32 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  24.32 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  24.32 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.71 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2659  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase  29.5 
 
 		 148 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.44 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.07 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  22.42 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.13 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.57 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  22.85 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.07 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  23.77 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>