More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2450 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2450  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 364 aa  754    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.702172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0808  Radical SAM domain protein  44.21 
 
 		 359 aa  290  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.63 
 
 		 479 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 377 aa  93.6  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 327 aa  86.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  26.35 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.29 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.66 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.36 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.74 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  26.99 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.98 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.29 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.62 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.63 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  27.58 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2153  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.06 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.666004  normal  0.11423 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1817  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.06 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  27.27 
 
 		 769 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.02 
 
 		 561 aa  70.1  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  26.78 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.76 
 
 		 496 aa  69.7  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1769  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.46 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.02 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  26.33 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  43.53 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  22.4 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.68 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.53 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.36 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.53 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.75 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  27.34 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.45 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.6 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.79 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  24.94 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0516  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.76 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.97 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.08 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.48 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  27.61 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.31 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.134726  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.14 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  39.53 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  24.78 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>