More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0808 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0808  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 359 aa  755    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2450  Radical SAM domain protein  44.21 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.702172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 497 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  28.35 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 380 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  25.07 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.86 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.28 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.48 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.65 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  24.51 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.45 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.32 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  25.71 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  24.35 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  24.08 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  24.08 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  24.08 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 350 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  22.51 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  23.08 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  24.71 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.61 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  23.49 
 
 		 769 aa  69.7  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  23.51 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  25.63 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  27.8 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.57 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.21 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  23.6 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  22.66 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.91 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.61 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.63 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  22.1 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.26 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.4 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.4 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  22.87 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.73 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  23.69 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>