184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4157 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4157  radical SAM superfamily protein  100 
 
 		 356 aa  740    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 497 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  25.85 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3165  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.76 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.43 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.2 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.43 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 481 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 		 462 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 482 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.43 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  26.62 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  22.39 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1198  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00512944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.82 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.05 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 		 354 aa  53.1  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.85 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.64 
 
 		 334 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 427 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.64 
 
 		 344 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  34.83 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  34.83 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 482 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  21.83 
 
 		 501 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  27.16 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  21.53 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.22 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.83 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.19 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.35 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 482 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.73 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.3 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3986  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0863511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 404 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.89 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.85 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.77 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.81 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.85 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.94 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 		 482 aa  50.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1101  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.69 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 		 347 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 460 aa  49.7  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 323 aa  49.7  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.02 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.07 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.43 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.14 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.78 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.35 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0195901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0900  Radical SAM domain protein  33.77 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.2 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.75 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.42 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.99 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.46 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0821  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.37 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.21 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1669  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.53 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.47 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.28 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.47 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6512  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.3 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397453  normal  0.0847554 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  35.44 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.63 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.36 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.134726  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.79 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 		 480 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.85 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.87 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 336 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  25.41 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 265 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>