131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0866 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  100 
 
 		 314 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  73.89 
 
 		 317 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  65.05 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  64.63 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  61.89 
 
 		 317 aa  381  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  56.23 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  57.48 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  60.52 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  55.23 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  56.49 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  58.12 
 
 		 321 aa  349  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  56.37 
 
 		 319 aa  349  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  59.03 
 
 		 319 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  49.67 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  54.05 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  52.66 
 
 		 329 aa  332  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  48.37 
 
 		 310 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  48.37 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  48.04 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  52.63 
 
 		 358 aa  305  7e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  52.13 
 
 		 314 aa  305  9.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  49.12 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  51.48 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  45.75 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  48.52 
 
 		 327 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  45.28 
 
 		 351 aa  268  8.999999999999999e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  47.56 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  46.15 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  48.84 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  46.18 
 
 		 335 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  46.75 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  46.5 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  44.16 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  45.54 
 
 		 332 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  45.7 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  44.87 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  43.59 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  43.81 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  43.28 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  44.74 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  43.56 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  43.56 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  43.58 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  43.24 
 
 		 319 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  38.64 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  24.28 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 429 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 405 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 323 aa  53.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  28 
 
 		 354 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.61 
 
 		 359 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  22.22 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 565 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 496 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 468 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 399 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.58 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 398 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  35.48 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 480 aa  49.7  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  35.48 
 
 		 387 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 345 aa  50.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.78 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  27.86 
 
 		 379 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  28.78 
 
 		 401 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 		 401 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 		 401 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  30.61 
 
 		 800 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 417 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  28 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.93 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 		 395 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 458 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 501 aa  47  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 410 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 389 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 418 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  33.1 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  19.15 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>