162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0915 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 351 aa  729    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  78.06 
 
 		 351 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  73.86 
 
 		 352 aa  548  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  59.58 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  48.56 
 
 		 351 aa  363  3e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  50.16 
 
 		 317 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  48.62 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  48.31 
 
 		 327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  47.44 
 
 		 338 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  48.51 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  47.99 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  47.59 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  47.67 
 
 		 310 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  46.98 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  48.99 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  47.92 
 
 		 329 aa  288  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  49.67 
 
 		 319 aa  288  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  49.5 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  44.3 
 
 		 316 aa  281  9e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  48.33 
 
 		 320 aa  279  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  47.32 
 
 		 310 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  45.77 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  45.51 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  49.36 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  46.77 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  44.1 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  47.1 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  45.43 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  44.11 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  44.74 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  44.28 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  44.59 
 
 		 314 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  47.47 
 
 		 317 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  44.7 
 
 		 314 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  46.75 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  41.87 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  42.69 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  44.92 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  41.56 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  41.56 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  41.93 
 
 		 324 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  41.31 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  44.69 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  43.23 
 
 		 319 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.87 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.9 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 380 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 		 800 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  28.33 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  29.05 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  34.67 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  29.53 
 
 		 595 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 422 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.64 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 347 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 330 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 381 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 1000 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 		 471 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 		 471 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  25.85 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.05 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  25.83 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  29.14 
 
 		 401 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 401 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 380 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 401 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 316 aa  49.3  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  26.21 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.38 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.18 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 579 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0823  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.5 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0317783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.12 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  25.95 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 412 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.54 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0117672 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  20.36 
 
 		 378 aa  46.2  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 496 aa  46.2  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 459 aa  46.2  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  26.67 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>