160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2228 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 332 aa  685    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  74.15 
 
 		 329 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  74.15 
 
 		 329 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  69.78 
 
 		 328 aa  481  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  65.65 
 
 		 337 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  67.6 
 
 		 335 aa  471  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  62.93 
 
 		 324 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  48.44 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  46.89 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  47.12 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  46.86 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  46.96 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  44.82 
 
 		 337 aa  275  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  44.61 
 
 		 364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  46.01 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  44.01 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  43.5 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  40.63 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  44.73 
 
 		 317 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  43.52 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  44.23 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  45.02 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  44.23 
 
 		 318 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  43.95 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  41.87 
 
 		 351 aa  258  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  45.51 
 
 		 310 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  42.68 
 
 		 358 aa  258  9e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  45.07 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  45.54 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  41.64 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  43.26 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  43.89 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  45.69 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  42.81 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  44.24 
 
 		 351 aa  252  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  43.67 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  42.9 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  42.68 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  39.88 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  38.85 
 
 		 341 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  36.65 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  36.22 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  26.86 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 579 aa  59.7  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.71 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 		 399 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28.66 
 
 		 561 aa  53.1  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 496 aa  53.1  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 380 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 460 aa  53.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  23.69 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  25.75 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  25.82 
 
 		 595 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  25.57 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 429 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  23.49 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 389 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 407 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  23.67 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  22.08 
 
 		 368 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 395 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.17 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  26.75 
 
 		 471 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0900  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 800 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 391 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  22.97 
 
 		 397 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  31.25 
 
 		 491 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  32.5 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 410 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 412 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  28.9 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  21.78 
 
 		 409 aa  46.2  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  28.9 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>