75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3751 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  73.27 
 
 		 318 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  54.4 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  44.92 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  44.69 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  48.03 
 
 		 317 aa  285  9e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  47.14 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  45.14 
 
 		 344 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 		 338 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  49.17 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  46.25 
 
 		 337 aa  278  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  45.83 
 
 		 321 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  46.82 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  44.1 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  45.61 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  45.6 
 
 		 314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  44.72 
 
 		 320 aa  272  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  43.65 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  41.3 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  46.05 
 
 		 314 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  46.91 
 
 		 320 aa  268  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  44.41 
 
 		 351 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  47.04 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  47.83 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  44.15 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  44.55 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  43.67 
 
 		 310 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  43.56 
 
 		 310 aa  255  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  42.43 
 
 		 322 aa  255  9e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  45.7 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  43.05 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  40.11 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  42.05 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  43.17 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  43.83 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  41.14 
 
 		 316 aa  241  9e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  43.05 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  42.04 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  41.94 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  42.11 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  42.58 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  40.68 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  38.83 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  42.62 
 
 		 329 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  42.62 
 
 		 329 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 800 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  27.52 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 		 459 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 440 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.71 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 579 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  38.75 
 
 		 417 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1253  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 468 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 461 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 1002 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  22.14 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 		 332 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3201  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.65 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.75 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 565 aa  42.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1705  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.75 
 
 		 337 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25 
 
 		 332 aa  42.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>