101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_06941 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  100 
 
 
310 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  95.48 
 
 
310 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  94.52 
 
 
310 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  84.52 
 
 
310 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  60 
 
 
314 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  59.6 
 
 
314 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  55.31 
 
 
311 aa  355  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  50 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  50.65 
 
 
332 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  51.63 
 
 
317 aa  334  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  49.68 
 
 
320 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  46.79 
 
 
337 aa  333  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  52.9 
 
 
320 aa  332  5e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  51.63 
 
 
322 aa  330  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  48.04 
 
 
314 aa  328  5.0000000000000004e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  50.33 
 
 
358 aa  325  6e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  49.51 
 
 
319 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  48.92 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  48.05 
 
 
321 aa  318  7e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  48.05 
 
 
319 aa  318  9e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  44.74 
 
 
364 aa  316  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  47.32 
 
 
351 aa  292  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  47.68 
 
 
308 aa  290  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  45.51 
 
 
351 aa  285  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  47.52 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  43.23 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  43.09 
 
 
344 aa  277  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  45.36 
 
 
318 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  45.51 
 
 
332 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  44.97 
 
 
327 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 
318 aa  268  8.999999999999999e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  45.05 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  42.81 
 
 
324 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  43.87 
 
 
335 aa  262  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  42.31 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  41.77 
 
 
351 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  43.05 
 
 
337 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 
341 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  39.66 
 
 
338 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  47.21 
 
 
316 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  37.38 
 
 
335 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  44.33 
 
 
329 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  44.33 
 
 
329 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  35.59 
 
 
319 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 
319 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  34.56 
 
 
459 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 
368 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  23.98 
 
 
595 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 
440 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 
800 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  27.74 
 
 
330 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.27 
 
 
359 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 
317 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 
415 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.86 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.16 
 
 
296 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 
326 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 
468 aa  49.3  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 
378 aa  49.3  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  20.75 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.93 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  22.97 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 
405 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 
429 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 
579 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  23.81 
 
 
391 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 
537 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 
368 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.07 
 
 
348 aa  46.2  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2549  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3375  radical SAM family protein  35.94 
 
 
640 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.85 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 
565 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 
480 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 
345 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  23.08 
 
 
379 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  25.68 
 
 
363 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  32.1 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  25.36 
 
 
491 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 
498 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
1002 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 
358 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  24.55 
 
 
410 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1465  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.33 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 
529 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 
365 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0244  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 
342 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0305821  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  42.37 
 
 
348 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 
391 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3047  radical SAM family protein  28.74 
 
 
153 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  29.52 
 
 
423 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 
412 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>