158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3555 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 337 aa  681    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  68.96 
 
 		 317 aa  474  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  69.94 
 
 		 320 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  63.02 
 
 		 321 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  62.39 
 
 		 319 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  58.63 
 
 		 322 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  64.22 
 
 		 317 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  62.09 
 
 		 319 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  64.63 
 
 		 314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  60.06 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  57.61 
 
 		 329 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  54.73 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  53.17 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  53.25 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  54.21 
 
 		 314 aa  361  8e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  47.71 
 
 		 310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  55.15 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  47.09 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  46.77 
 
 		 310 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  46.79 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  50.62 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  52.27 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  47.99 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  48.11 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  46.25 
 
 		 337 aa  278  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  44.82 
 
 		 332 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  46.34 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  46.77 
 
 		 351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  45.91 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  42.11 
 
 		 351 aa  272  8.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  47.71 
 
 		 337 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  45.14 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  46.06 
 
 		 324 aa  268  7e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  42.6 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  43.77 
 
 		 318 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  43.29 
 
 		 335 aa  256  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  42.33 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  41.88 
 
 		 329 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  41.88 
 
 		 329 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  39.45 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  41.61 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  43.73 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  42.17 
 
 		 319 aa  228  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  41.53 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  34.15 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.88 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  35.21 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 800 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  33.08 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 468 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 		 411 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 		 529 aa  52.8  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  32.64 
 
 		 480 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  32.91 
 
 		 1014 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  36.22 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  29.23 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.52 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 565 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 440 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.46 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 496 aa  50.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 384 aa  50.1  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 		 608 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.76 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  28.03 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 		 405 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  26.75 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3047  radical SAM family protein  35.63 
 
 		 153 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.4 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  29.93 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  24.71 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 471 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 459 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  30.77 
 
 		 387 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>