More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2032 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 411 aa  840    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  47.57 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2252  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 		 404 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.2 
 
 		 479 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.12 
 
 		 496 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 391 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  34.59 
 
 		 565 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  30.42 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30.34 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  31.28 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.93 
 
 		 346 aa  89.7  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 501 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  24.26 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  27.22 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.96 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  25.95 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  27.15 
 
 		 374 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  27.51 
 
 		 387 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  28.9 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 380 aa  87  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 393 aa  86.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.57 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  29.57 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  33.17 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0881  radical SAM family Fe-S protein  27.69 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.730435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  30.09 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  26.48 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.3 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.93 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.57 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0689  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.42 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.62446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.62 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  26.52 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  24.09 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  37.76 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  23.37 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.15 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.57 
 
 		 561 aa  75.1  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5988  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.62 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  26.36 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  25.68 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.69 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 		 516 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.17 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.74 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.46 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  26.14 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  27.55 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>