More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0967 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 355 aa  734    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  63.07 
 
 		 351 aa  454  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  62.96 
 
 		 351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  25.47 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 421 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 384 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  25.29 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  22.81 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 		 450 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 445 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  22.57 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 451 aa  89.7  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 515 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 390 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 		 465 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 445 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 372 aa  86.3  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  22.15 
 
 		 873 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  27.71 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  22.5 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  27.96 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  24.92 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  21.94 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  23.15 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.28 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.99 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  29.32 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 513 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  21.41 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.08 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  25.3 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  22.6 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  29.49 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  25.3 
 
 		 292 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  25.3 
 
 		 292 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  25.3 
 
 		 292 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  21.71 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  25.3 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.51 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  25.3 
 
 		 292 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.93 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  25.3 
 
 		 292 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  21.63 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  25.77 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  25 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  27.67 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  23.89 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.77 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  22.05 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  24.86 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  21.13 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  23.12 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  20.6 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  30.64 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>