More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1542 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  100 
 
 
372 aa  774    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  35.83 
 
 
384 aa  250  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  37.21 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 
445 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 
421 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  35.64 
 
 
445 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 
450 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 
451 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  38.17 
 
 
446 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 
340 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  37.12 
 
 
446 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  30.54 
 
 
471 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  36.5 
 
 
437 aa  96.3  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  38.17 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 
465 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  27.78 
 
 
447 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 
377 aa  92.8  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  23.63 
 
 
397 aa  90.1  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
380 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  40.35 
 
 
513 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 
411 aa  87  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 
415 aa  86.3  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  34.13 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  22.25 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  22.32 
 
 
340 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  23.84 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  21.99 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.83 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  22.19 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  21.61 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 
873 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  21.93 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  33.33 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  22.52 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  21.55 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.93 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.31 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  21.87 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  33.64 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  21.74 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  21.75 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  23.26 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 
513 aa  66.2  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  23.53 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  20 
 
 
387 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  22.05 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 
468 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  21.61 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  20.39 
 
 
394 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 
565 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  21.69 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.5 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 
496 aa  63.9  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.54 
 
 
323 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  31.36 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 
358 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.29 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  27 
 
 
330 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  21.84 
 
 
387 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  22.53 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  22.56 
 
 
429 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  22.5 
 
 
358 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.23 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  24.26 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>