More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0881 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0881  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 351 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.730435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.18 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.18 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  24.63 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0429  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  32.39 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.8 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0506  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 		 565 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 		 496 aa  66.2  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  29.28 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  30.17 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  29.28 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  30.17 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.53 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0586  radical SAM family protein  24.41 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  28.73 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25.96 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.14 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  30.53 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  27.44 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1814  radical SAM family protein  29.01 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2825  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  30.08 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5563  radical SAM domain protein, putative  25.66 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03073e-42 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  23.5 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  27.66 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1935  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.100874 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  24.72 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  26.74 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  27.03 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  24.78 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 429 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  24.39 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2622  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7439  Fe-S oxidoreductase-like protein  29.51 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.6 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.17 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.17 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  23.3 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  31.15 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 489 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 460 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  30.58 
 
 		 355 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  23.62 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  27.88 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>