More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3158 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 428 aa  877    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  47.57 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 351 aa  113  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2252  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 		 394 aa  96.7  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 		 565 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  32.8 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  26.01 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 369 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.69 
 
 		 479 aa  89.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 501 aa  89.4  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 384 aa  89  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 		 340 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 496 aa  87.8  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  29.29 
 
 		 379 aa  86.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 480 aa  86.7  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.49 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0881  radical SAM family Fe-S protein  26.61 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.730435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22.77 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  22.96 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.22 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.28 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.21 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.84 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.65 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.16 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  30.66 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  26.15 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  34.74 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  21.53 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.27 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  26.65 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.08 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.17 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  25.76 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  24.46 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  25.85 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.1 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  33.58 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  21.27 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 330 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  28.77 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.44 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  26.7 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3986  radical SAM domain-containing protein  32.63 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0863511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  24.25 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>