93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2384 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 364 aa  754    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  41.72 
 
 		 348 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0891  hypothetical protein  27.69 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3720  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0048621  normal  0.524582 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3357  radical SAM family protein  26.93 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158709  normal  0.0575022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0858  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1410  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2162  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.211612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2181  hypothetical protein  23.22 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0928383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1384  Radical SAM domain protein  22.57 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  hitchhiker  0.00082809 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3375  radical SAM family protein  27.91 
 
 		 640 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0390  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000824452  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1611  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0924  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  33.11 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 418 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2498  Radical SAM domain protein  31.48 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.608052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 		 428 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 		 362 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  26.06 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  47.54 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 1039 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  42.62 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.73 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 1000 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2394  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0900  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  23.33 
 
 		 1005 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  30.38 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.11 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  27.43 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  34.72 
 
 		 1014 aa  46.6  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 429 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 800 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  38.27 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 565 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  32.5 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  38.27 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1409  hypothetical protein  23.72 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.287202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  29.73 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  34.94 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.38 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  35.37 
 
 		 481 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  21.07 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 1002 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.07 
 
 		 238 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  35.53 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  28.95 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  43.08 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0341  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  23.36 
 
 		 231 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 312 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  23.28 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 		 368 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  31.31 
 
 		 579 aa  43.1  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 		 399 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4646  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 371 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0225  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.79 
 
 		 239 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0603054  normal  0.555602 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 501 aa  42.7  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  39.34 
 
 		 332 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 345 aa  42.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>