153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2498 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2498  Radical SAM domain protein  100 
 
 
402 aa  831    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.608052  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2576  hypothetical protein  82.97 
 
 
182 aa  324  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2577  hypothetical protein  87.86 
 
 
189 aa  316  6e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.12 
 
 
346 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 
361 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.9 
 
 
349 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.12 
 
 
372 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0858  Radical SAM domain protein  31.48 
 
 
349 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.46 
 
 
335 aa  53.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.68 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  31.48 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.68 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 
354 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.77 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  28.06 
 
 
292 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  28.08 
 
 
330 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.13 
 
 
392 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  22.4 
 
 
496 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.12 
 
 
348 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  23.9 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 
516 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 
377 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0354  radical SAM domain-containing protein  34.04 
 
 
377 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.880417 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 
397 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.41 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.33 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 
333 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  22.16 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 
394 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 
358 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 
358 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.51 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.76 
 
 
331 aa  50.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 
428 aa  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  26.32 
 
 
335 aa  49.7  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 
393 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 
427 aa  49.7  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  29 
 
 
462 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.58 
 
 
325 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.93 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0883  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.2 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3837  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.38 
 
 
356 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  22.93 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  26.35 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.6 
 
 
324 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  30.59 
 
 
376 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  25.85 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.12 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.36 
 
 
561 aa  47.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2293  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.49 
 
 
340 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2335  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.49 
 
 
340 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.11 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2181  hypothetical protein  28.97 
 
 
355 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0928383  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2659  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 
386 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00949388  normal  0.0744844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.06 
 
 
326 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
332 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.21 
 
 
380 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.81 
 
 
341 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  34.52 
 
 
409 aa  47  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.14 
 
 
394 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1799  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.82 
 
 
391 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125674  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
333 aa  46.6  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1706  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.1 
 
 
370 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0251054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.62 
 
 
296 aa  46.6  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.04 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.01 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.05 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  23.11 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.97 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  29.89 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.51 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.92 
 
 
326 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  21.64 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  28.85 
 
 
326 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.05 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.12 
 
 
298 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  40.68 
 
 
769 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.3 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  31.68 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  31.68 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>