55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2577 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2577  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2498  Radical SAM domain protein  87.86 
 
 
402 aa  316  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.608052  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 
327 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 
333 aa  52  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 
330 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 
330 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 
342 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
333 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  31.88 
 
 
346 aa  49.3  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  35.59 
 
 
391 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30.19 
 
 
349 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 
405 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.36 
 
 
335 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 
407 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  39.34 
 
 
395 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 
380 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.82 
 
 
399 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  35.59 
 
 
393 aa  45.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 
359 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 
332 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  38.98 
 
 
769 aa  45.1  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  32.05 
 
 
405 aa  45.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 
377 aa  44.7  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  42.37 
 
 
334 aa  44.7  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 
361 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  36.21 
 
 
397 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0858  Radical SAM domain protein  32.18 
 
 
349 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 
394 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  25.87 
 
 
356 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  34.92 
 
 
377 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 
393 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  22.95 
 
 
377 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 
384 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.07 
 
 
325 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 
358 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 
349 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 
377 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  32 
 
 
399 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 
414 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 
358 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  33.9 
 
 
496 aa  43.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.47 
 
 
397 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  38.98 
 
 
422 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  34.92 
 
 
428 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 
354 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 
356 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 
409 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  23.45 
 
 
390 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 
390 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.79 
 
 
479 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  26.56 
 
 
413 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  35.59 
 
 
394 aa  41.6  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  27.06 
 
 
326 aa  41.6  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 
393 aa  41.2  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  29.91 
 
 
292 aa  41.2  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>