More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1392 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 377 aa  786    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 338 aa  92.8  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  28.12 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 480 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  29.22 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  33.18 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.27 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.27 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  32.76 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  33.18 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.75 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.81 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  24.48 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  29.1 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.64 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  32.21 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  32 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  36.84 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.47 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  33.54 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.23 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  24.93 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  27.75 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30.21 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.06 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.03 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.75 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  35.4 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  28.29 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.06 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.37 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.58 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.23 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  36.28 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  27.14 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1465  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.39 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.67 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  38.05 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  35.17 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  30.84 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.22 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.623593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0429  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  33.06 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.82 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.82 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  31.34 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  28.27 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.15 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.73 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>