More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0737 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 312 aa  650    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  45.16 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  44.37 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  26.49 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  24.49 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 		 453 aa  75.9  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  36.54 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0244  Radical SAM domain protein  24.39 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0305821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  33.99 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  30.15 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.33 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  37.86 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  39.24 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.5 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  24.13 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  31.78 
 
 		 479 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  29.63 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0883  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.29 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 		 380 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.73 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  37.27 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0429  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  29.03 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  26.06 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.29 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.05 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.36 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  31.13 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  32.48 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.53 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  33.03 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.77 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.63 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.43 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.24 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.77 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1805  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.644596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.36 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  23.55 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.47 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.34 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.36 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.22 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  33.05 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.36 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  25.18 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  33.91 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3305  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.36 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2586  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.36 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.16 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.16 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.37 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  34.48 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.11 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.73 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>