24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1384 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1384  Radical SAM domain protein  100 
 
 
330 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  hitchhiker  0.00082809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  22.57 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0390  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000824452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0891  hypothetical protein  22.36 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.03 
 
 
347 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.02 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1444  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.39 
 
 
380 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000773011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  22.88 
 
 
327 aa  46.2  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.39 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1409  hypothetical protein  25.55 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.287202  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.13 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.88 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.13 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3455  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 
511 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.76 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3720  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0048621  normal  0.524582 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.27 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0807  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 
507 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2394  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 
333 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.95 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 
380 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.75 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>