121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1410 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1410  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 370 aa  752    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0891  hypothetical protein  28.06 
 
 		 344 aa  89.7  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3720  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0048621  normal  0.524582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3357  radical SAM family protein  23.75 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158709  normal  0.0575022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  22.69 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.17 
 
 		 399 aa  52.8  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0858  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  32.76 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.71 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  21.76 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1409  hypothetical protein  26.67 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.287202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1611  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  29.45 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  31.25 
 
 		 332 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  27.57 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3375  radical SAM family protein  31.16 
 
 		 640 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.06 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  37.39 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.66 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.77 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2181  hypothetical protein  25.71 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0928383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.67 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.34 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.34 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.09 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.32 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  36.26 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.35 
 
 		 255 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  32.71 
 
 		 404 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2417  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.03 
 
 		 281 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000163232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2672  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.62 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.209524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2379  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.1 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0648375  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.96 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  33 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.21 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1817  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.25 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0516  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.48 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.95 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1769  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.25 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.67 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  34.75 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2153  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.25 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.666004  normal  0.11423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.96 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  29.41 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  28.03 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  22.11 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  22.11 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.56 
 
 		 238 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2691  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.1 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00335137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2770  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.1 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.789492  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.33 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3391  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.04 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1693  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.1 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  22.11 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.72 
 
 		 247 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  32.65 
 
 		 474 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  33.04 
 
 		 216 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.06 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.33 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2549  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 216 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23 
 
 		 243 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.96 
 
 		 386 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  36.04 
 
 		 226 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  31.09 
 
 		 595 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  36.94 
 
 		 215 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  39.18 
 
 		 206 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1799  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.67 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125674  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  36.14 
 
 		 382 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  22 
 
 		 243 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  22 
 
 		 243 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.32 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  36.04 
 
 		 264 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.16 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 		 393 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>