19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0924 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0924  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 340 aa  689    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0390  Radical SAM domain protein  37.87 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000824452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2394  radical SAM domain-containing protein  32.36 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1611  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3720  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0048621  normal  0.524582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2162  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.211612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0891  hypothetical protein  25.23 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2181  hypothetical protein  29.75 
 
 		 355 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0928383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3375  radical SAM family protein  25.56 
 
 		 640 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3357  radical SAM family protein  23.81 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158709  normal  0.0575022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  34.62 
 
 		 481 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.59 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 513 aa  43.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 452 aa  42.7  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>