43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2394 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2394  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 333 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0390  Radical SAM domain protein  44.68 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000824452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0924  Radical SAM domain protein  32.36 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3375  radical SAM family protein  34.44 
 
 		 640 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2181  hypothetical protein  27.92 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0928383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3720  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0048621  normal  0.524582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3357  radical SAM family protein  27.54 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158709  normal  0.0575022 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  28.31 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1611  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  35.48 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1425  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6404  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0257  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.862128  normal  0.0494726 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7063  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.23 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00651561  normal  0.935573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.2 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.7 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.95 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6965  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.74 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2695  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 423 aa  46.2  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6446  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.54 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.928018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0858  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  25.39 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.75 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.75 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.74 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.512935  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.75 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.39 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0574  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.68 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.62 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.52 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.2 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  36.36 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1384  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  hitchhiker  0.00082809 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.17 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.69 
 
 		 397 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.12 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.85 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.89 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>