More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5688 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6965  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  90.91 
 
 
374 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7063  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  89.04 
 
 
374 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00651561  normal  0.935573 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6446  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  96.77 
 
 
371 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.928018 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
372 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.512935  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1425  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  88.77 
 
 
374 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6404  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  88.77 
 
 
374 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  81.28 
 
 
408 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0273592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3837  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  71.51 
 
 
356 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1689  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.83 
 
 
376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2288  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.02 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2276  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.47 
 
 
396 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.65 
 
 
373 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0904  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.07 
 
 
373 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0102552  normal  0.0824176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1039  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.18 
 
 
373 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491937  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.88 
 
 
369 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0817  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.27 
 
 
370 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00537332  normal  0.704127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.59 
 
 
369 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55 
 
 
395 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4885  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.6 
 
 
378 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0519  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.13 
 
 
360 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.13 
 
 
363 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00347388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2864  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.13 
 
 
377 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2194  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.43 
 
 
370 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734508  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0630  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.56 
 
 
370 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2492  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.13 
 
 
363 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0107198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1815  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.13 
 
 
363 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1109  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.56 
 
 
370 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.038115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1068  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.56 
 
 
370 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0439082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4222  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.97 
 
 
370 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1706  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.25 
 
 
370 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0251054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2803  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.84 
 
 
377 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000449435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0989  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.56 
 
 
370 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197702  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.56 
 
 
370 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.637479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2659  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.53 
 
 
386 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00949388  normal  0.0744844 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2919  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.25 
 
 
370 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00151708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2292  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.39 
 
 
381 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1468  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.12 
 
 
388 aa  362  6e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.99 
 
 
384 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2343  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.13 
 
 
383 aa  352  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  52.2 
 
 
359 aa  352  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1749  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.89 
 
 
378 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.98 
 
 
371 aa  348  6e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02449  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55 
 
 
343 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.03 
 
 
378 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.41 
 
 
334 aa  342  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.29 
 
 
337 aa  342  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.53 
 
 
337 aa  340  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.41 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.41 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.71 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.41 
 
 
337 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.41 
 
 
337 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.53 
 
 
337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0399  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.35 
 
 
337 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245923  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.35 
 
 
337 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.82 
 
 
337 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.12 
 
 
337 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4475  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.55 
 
 
337 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4843  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.94 
 
 
337 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4457  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.94 
 
 
339 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.97 
 
 
337 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1581  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.71 
 
 
341 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.15 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1648  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  48.61 
 
 
362 aa  317  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.22 
 
 
338 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3677  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.51 
 
 
338 aa  316  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.93 
 
 
338 aa  315  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3363  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.93 
 
 
338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.22 
 
 
338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3627  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.93 
 
 
338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.82 
 
 
340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1640  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.64 
 
 
338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2335  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.61 
 
 
340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2293  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.61 
 
 
340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1351  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.53 
 
 
340 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.22 
 
 
338 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.35 
 
 
338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0729  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.24 
 
 
340 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000041068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.86 
 
 
333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.54 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.34 
 
 
306 aa  292  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.86 
 
 
338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.78 
 
 
345 aa  249  7e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.52 
 
 
333 aa  247  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4622  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, N-terminus  50.67 
 
 
252 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A moaA1  39.78 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0851136 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3299  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.2 
 
 
347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483331 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2640  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.04 
 
 
347 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.45 
 
 
335 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.12 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.39 
 
 
335 aa  219  7e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.3 
 
 
349 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  42.66 
 
 
333 aa  216  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  42.86 
 
 
338 aa  216  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  40 
 
 
329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.83 
 
 
326 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2295  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.44 
 
 
329 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0301  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  42.16 
 
 
326 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  37.9 
 
 
333 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.24 
 
 
326 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>