More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2695 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2695  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 423 aa  868    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  24.93 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4663  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0193587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.29 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.06 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  22.09 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  23.47 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.18 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0354  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.880417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.6 
 
 		 342 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.6 
 
 		 342 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  27.98 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.7 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  30.92 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  29.25 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  22.45 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0182  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.796487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.67 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  21.36 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.3 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.85 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 608 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.83 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.41 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  29.31 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.17 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.21 
 
 		 317 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  21 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.29 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0429  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0904  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.05 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0102552  normal  0.0824176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  28.9 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.28 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  31.22 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.14 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.71 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.88 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.39 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.43 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.82 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 513 aa  57  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.7 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.05 
 
 		 321 aa  57  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.57 
 
 		 338 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.5 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.55 
 
 		 326 aa  57  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.64 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  30.68 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.12 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.95 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.95 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.85 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  26.03 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 356 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.95 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.95 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.11 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  21.9 
 
 		 561 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.95 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  32.81 
 
 		 326 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>