More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0429 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0429  Radical SAM domain protein  100 
 
 
324 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  42.76 
 
 
327 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  41.64 
 
 
326 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.497246 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  30.13 
 
 
344 aa  116  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 
338 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  32.2 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  35.33 
 
 
399 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  31.58 
 
 
479 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  26.6 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  35.63 
 
 
380 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 
496 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.33 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 
480 aa  85.9  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  33.72 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  33.72 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  31.87 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 
414 aa  79  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.6 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 
429 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.64 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  31.87 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 
364 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 
347 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  23.91 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.57 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.57 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.57 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.61 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.29 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  24.48 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.58 
 
 
386 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 
399 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5965  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.51 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0233125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  23.24 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.95 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 
501 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.18 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.99 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1702  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.54 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.475579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0881  radical SAM family Fe-S protein  28.22 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.730435  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.63 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.14 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.72 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  34.71 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  27.12 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.72 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.75 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.26 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  31.74 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  31.64 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.18 
 
 
397 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  31.74 
 
 
418 aa  69.3  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.54 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  30.06 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.37 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  28.27 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  27.86 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  35.59 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 
404 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>