More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0724 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
335 aa  698    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  82.63 
 
 
336 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  79.53 
 
 
345 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.92 
 
 
339 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.62 
 
 
355 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.02 
 
 
344 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.47 
 
 
344 aa  514  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.76 
 
 
351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  67.27 
 
 
346 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.36 
 
 
345 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.35 
 
 
345 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.86 
 
 
350 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.35 
 
 
343 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.34 
 
 
344 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.36 
 
 
334 aa  431  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.37 
 
 
346 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.16 
 
 
329 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.99 
 
 
344 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.98 
 
 
345 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.06 
 
 
344 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.35 
 
 
351 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.65 
 
 
344 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.28 
 
 
344 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.68 
 
 
349 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.98 
 
 
344 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.77 
 
 
344 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.24 
 
 
343 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.96 
 
 
347 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0726639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.47 
 
 
344 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.47 
 
 
344 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.95 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.25 
 
 
348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3050  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.16 
 
 
338 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3777  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.16 
 
 
338 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.579463  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.29 
 
 
348 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1879  molybdenum cofactor synthesis-like  60.24 
 
 
354 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1605  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.42 
 
 
331 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.1 
 
 
340 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.18 
 
 
338 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2122  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.83 
 
 
340 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.08 
 
 
342 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  54.17 
 
 
365 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.94 
 
 
332 aa  353  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5676  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.23 
 
 
340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  55.39 
 
 
339 aa  350  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  53.59 
 
 
339 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  51.96 
 
 
340 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  50.15 
 
 
343 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0325  molybdenum cofactor biosynthesis protein  51.5 
 
 
335 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2357  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  46.87 
 
 
331 aa  333  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.719976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1520  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  53.43 
 
 
346 aa  325  7e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.886892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.15 
 
 
335 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  50 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.2 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.59 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.2 
 
 
329 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  47.89 
 
 
329 aa  315  7e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.95 
 
 
332 aa  315  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.57 
 
 
331 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.25 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.69 
 
 
341 aa  312  6.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.95 
 
 
334 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  48.66 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.25 
 
 
334 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.95 
 
 
334 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.49 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.59 
 
 
327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.19 
 
 
331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.96 
 
 
327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1949  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.49 
 
 
343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.79 
 
 
332 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.01 
 
 
327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.49 
 
 
332 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.71 
 
 
327 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.71 
 
 
327 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.99 
 
 
327 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.99 
 
 
327 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.69 
 
 
328 aa  298  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.99 
 
 
327 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.99 
 
 
331 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.39 
 
 
327 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  46.08 
 
 
330 aa  295  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.08 
 
 
327 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.39 
 
 
328 aa  291  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.39 
 
 
328 aa  288  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.86 
 
 
340 aa  286  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.01 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.37 
 
 
327 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.78 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.01 
 
 
334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.08 
 
 
327 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.51 
 
 
328 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.31 
 
 
327 aa  262  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  43.79 
 
 
331 aa  259  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1615  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.94 
 
 
596 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.97 
 
 
346 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  40.54 
 
 
329 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2577  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  42.34 
 
 
323 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.646455  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.87 
 
 
336 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.71 
 
 
327 aa  232  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>