More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2072 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
329 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  80.24 
 
 
349 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  80.55 
 
 
344 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  79.33 
 
 
345 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  79.03 
 
 
334 aa  551  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  80.24 
 
 
344 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  82.67 
 
 
348 aa  547  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  82.67 
 
 
348 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.16 
 
 
351 aa  527  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  75.99 
 
 
345 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  75.99 
 
 
344 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  75.38 
 
 
345 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.47 
 
 
344 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.47 
 
 
344 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  73.56 
 
 
344 aa  507  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  73.56 
 
 
343 aa  501  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  73.56 
 
 
343 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.52 
 
 
351 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  71.73 
 
 
350 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  73.86 
 
 
346 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.77 
 
 
344 aa  484  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.47 
 
 
344 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.16 
 
 
344 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  72.95 
 
 
346 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.91 
 
 
347 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0726639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.09 
 
 
340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.82 
 
 
348 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  67.27 
 
 
355 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1605  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.3 
 
 
331 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.67 
 
 
344 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.36 
 
 
339 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.87 
 
 
345 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.18 
 
 
344 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.16 
 
 
335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2122  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  67.48 
 
 
340 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.16 
 
 
336 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.01 
 
 
342 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5676  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  67.48 
 
 
340 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  61.56 
 
 
365 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1879  molybdenum cofactor synthesis-like  64.74 
 
 
354 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  59.57 
 
 
339 aa  394  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1520  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  62.16 
 
 
346 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.886892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.98 
 
 
338 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  56.67 
 
 
340 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  57.75 
 
 
339 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0325  molybdenum cofactor biosynthesis protein  55.02 
 
 
335 aa  360  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  56.23 
 
 
337 aa  358  5e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3050  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.15 
 
 
338 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3777  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.15 
 
 
338 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.579463  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  52.42 
 
 
357 aa  338  9e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  52.11 
 
 
332 aa  335  5e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  51.36 
 
 
343 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.36 
 
 
329 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.36 
 
 
329 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1949  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.51 
 
 
343 aa  316  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.7 
 
 
335 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2357  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  48.19 
 
 
331 aa  316  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.719976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.78 
 
 
341 aa  310  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.25 
 
 
332 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.8 
 
 
331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.4 
 
 
330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.15 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  48.8 
 
 
330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.85 
 
 
334 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.85 
 
 
334 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.05 
 
 
332 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.05 
 
 
332 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.95 
 
 
334 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.43 
 
 
327 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.04 
 
 
327 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.43 
 
 
328 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.49 
 
 
331 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.13 
 
 
327 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.13 
 
 
327 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.19 
 
 
331 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.83 
 
 
327 aa  289  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.83 
 
 
340 aa  286  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.58 
 
 
329 aa  285  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.89 
 
 
331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.43 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.43 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.43 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.53 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.53 
 
 
328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.83 
 
 
327 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.53 
 
 
328 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.13 
 
 
346 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1615  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.8 
 
 
596 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.92 
 
 
328 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.92 
 
 
327 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.44 
 
 
328 aa  267  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.22 
 
 
328 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.98 
 
 
334 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.88 
 
 
327 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.41 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  41.14 
 
 
331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.77 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.77 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2577  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  43.11 
 
 
323 aa  242  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.646455  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.43 
 
 
344 aa  241  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>