More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3389 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
345 aa  700    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  91.28 
 
 
344 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  87.83 
 
 
344 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  83.19 
 
 
344 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  79.07 
 
 
344 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  80.77 
 
 
343 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  82.37 
 
 
343 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  72.75 
 
 
351 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  73.11 
 
 
334 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.28 
 
 
345 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.62 
 
 
344 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  71.9 
 
 
349 aa  501  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.33 
 
 
344 aa  501  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.2 
 
 
350 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  75.38 
 
 
329 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.07 
 
 
351 aa  484  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  71.51 
 
 
348 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.55 
 
 
345 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  72.3 
 
 
346 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  73.04 
 
 
344 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.75 
 
 
348 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  71.55 
 
 
346 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  73.04 
 
 
344 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  73.37 
 
 
344 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.86 
 
 
347 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0726639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.98 
 
 
339 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.9 
 
 
355 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.9 
 
 
344 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.48 
 
 
344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.78 
 
 
348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.67 
 
 
340 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.09 
 
 
345 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.35 
 
 
335 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.26 
 
 
336 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1605  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.16 
 
 
331 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2122  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.57 
 
 
340 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.88 
 
 
342 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  62.46 
 
 
365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5676  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.5 
 
 
340 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  59.64 
 
 
339 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1879  molybdenum cofactor synthesis-like  62.61 
 
 
354 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  59.7 
 
 
340 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.19 
 
 
338 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  56.8 
 
 
339 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0325  molybdenum cofactor biosynthesis protein  56.84 
 
 
335 aa  358  6e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1520  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  56.07 
 
 
346 aa  348  7e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.886892 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3050  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.48 
 
 
338 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3777  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.48 
 
 
338 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.579463  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  53.27 
 
 
337 aa  341  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  50.44 
 
 
343 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.59 
 
 
332 aa  338  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.13 
 
 
335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.66 
 
 
329 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  49.43 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.36 
 
 
329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1949  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.43 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.1 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.5 
 
 
330 aa  305  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2357  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.81 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.719976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.2 
 
 
332 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.5 
 
 
332 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.9 
 
 
332 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  50.32 
 
 
330 aa  296  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.77 
 
 
334 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.87 
 
 
327 aa  292  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.8 
 
 
341 aa  291  9e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.51 
 
 
329 aa  291  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.62 
 
 
334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.62 
 
 
334 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.73 
 
 
334 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.85 
 
 
328 aa  287  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.15 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.2 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.15 
 
 
327 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.15 
 
 
327 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.45 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.9 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.85 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.95 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.5 
 
 
331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.15 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.95 
 
 
327 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.24 
 
 
328 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.06 
 
 
340 aa  279  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.35 
 
 
327 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.35 
 
 
327 aa  278  9e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.74 
 
 
327 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.15 
 
 
328 aa  269  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.78 
 
 
327 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1615  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.76 
 
 
596 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  43.71 
 
 
327 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.88 
 
 
334 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.74 
 
 
328 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  43.71 
 
 
327 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  42.27 
 
 
331 aa  259  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.11 
 
 
346 aa  256  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  40.18 
 
 
329 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.86 
 
 
344 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.44 
 
 
326 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.4 
 
 
329 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>