More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1290 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
336 aa  692    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  82.63 
 
 
335 aa  585  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  79.59 
 
 
345 aa  557  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  75.52 
 
 
339 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  75.23 
 
 
355 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.62 
 
 
344 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  74.77 
 
 
344 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.97 
 
 
345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.87 
 
 
345 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.67 
 
 
350 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.55 
 
 
351 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.97 
 
 
346 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.26 
 
 
343 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.07 
 
 
344 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.67 
 
 
344 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.67 
 
 
344 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.26 
 
 
345 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.95 
 
 
351 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.56 
 
 
344 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.56 
 
 
344 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.1 
 
 
334 aa  428  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.75 
 
 
343 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.95 
 
 
344 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.97 
 
 
344 aa  421  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.67 
 
 
344 aa  421  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.58 
 
 
347 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0726639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.97 
 
 
344 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.67 
 
 
346 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.35 
 
 
329 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.49 
 
 
349 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.05 
 
 
348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.75 
 
 
348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1605  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.76 
 
 
331 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1879  molybdenum cofactor synthesis-like  60.84 
 
 
354 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.1 
 
 
348 aa  388  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3777  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.56 
 
 
338 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.579463  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3050  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.56 
 
 
338 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.4 
 
 
340 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.68 
 
 
338 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2122  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.73 
 
 
340 aa  361  8e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  54.46 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.17 
 
 
342 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  55.56 
 
 
339 aa  352  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  51.04 
 
 
343 aa  349  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.6 
 
 
332 aa  349  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5676  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.83 
 
 
340 aa  345  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0325  molybdenum cofactor biosynthesis protein  51.34 
 
 
335 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  51.96 
 
 
340 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  52.71 
 
 
339 aa  337  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.55 
 
 
334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2357  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.7 
 
 
331 aa  325  6e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.719976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.55 
 
 
335 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.26 
 
 
334 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.2 
 
 
327 aa  322  7e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.26 
 
 
334 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.18 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1520  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  51.93 
 
 
346 aa  320  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.886892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  50.6 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.63 
 
 
332 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  47.01 
 
 
329 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.11 
 
 
341 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.65 
 
 
334 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.29 
 
 
331 aa  316  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.3 
 
 
329 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.3 
 
 
329 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.71 
 
 
327 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  48.49 
 
 
357 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.15 
 
 
328 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.41 
 
 
327 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.02 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.77 
 
 
331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.77 
 
 
331 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.41 
 
 
327 aa  309  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.99 
 
 
327 aa  308  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.72 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.99 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.99 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.99 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.51 
 
 
327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.15 
 
 
328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.08 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1949  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.49 
 
 
343 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.85 
 
 
328 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.18 
 
 
331 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.87 
 
 
328 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  44.58 
 
 
330 aa  286  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.95 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.79 
 
 
340 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1615  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.25 
 
 
596 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.81 
 
 
328 aa  269  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.74 
 
 
327 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.24 
 
 
334 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  43.2 
 
 
327 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  43.2 
 
 
331 aa  258  8e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  43.79 
 
 
327 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2577  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  44.74 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.646455  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.63 
 
 
346 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  38.87 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.02 
 
 
326 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.02 
 
 
326 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>