More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2703 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
345 aa  706    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  73 
 
 
345 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  73.29 
 
 
344 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  73 
 
 
344 aa  519  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.8 
 
 
351 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  72.64 
 
 
349 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  75.99 
 
 
329 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.71 
 
 
344 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.18 
 
 
334 aa  491  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.79 
 
 
351 aa  488  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.41 
 
 
344 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.33 
 
 
350 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.62 
 
 
348 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.78 
 
 
348 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  67.84 
 
 
344 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.39 
 
 
344 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.53 
 
 
343 aa  482  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.55 
 
 
345 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70.21 
 
 
343 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.28 
 
 
347 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0726639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.91 
 
 
355 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.44 
 
 
346 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.33 
 
 
344 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.6 
 
 
344 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.14 
 
 
346 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1605  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  67.98 
 
 
331 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.31 
 
 
344 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  68.25 
 
 
344 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.16 
 
 
348 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.91 
 
 
345 aa  448  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.16 
 
 
344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.91 
 
 
340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  66.97 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.64 
 
 
339 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  65.36 
 
 
335 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  62.54 
 
 
339 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2122  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.85 
 
 
340 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  61 
 
 
365 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.88 
 
 
342 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1879  molybdenum cofactor synthesis-like  63.33 
 
 
354 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.6 
 
 
338 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5676  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  64.24 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  59.09 
 
 
339 aa  393  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1520  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  58.06 
 
 
346 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.886892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0325  molybdenum cofactor biosynthesis protein  56.53 
 
 
335 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  55.15 
 
 
340 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  54.03 
 
 
337 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3050  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.49 
 
 
338 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3777  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.49 
 
 
338 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.579463  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  52.82 
 
 
332 aa  343  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  49.12 
 
 
343 aa  322  6e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  50.6 
 
 
330 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  48.18 
 
 
357 aa  308  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.62 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.4 
 
 
331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.7 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.2 
 
 
331 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.49 
 
 
340 aa  301  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.62 
 
 
335 aa  298  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.34 
 
 
327 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.34 
 
 
327 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2357  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.21 
 
 
331 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.719976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.34 
 
 
327 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.45 
 
 
327 aa  296  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1949  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.4 
 
 
343 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.73 
 
 
327 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.66 
 
 
329 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.66 
 
 
329 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.55 
 
 
327 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.04 
 
 
328 aa  291  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.46 
 
 
328 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.25 
 
 
327 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.65 
 
 
334 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.95 
 
 
327 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.16 
 
 
328 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.25 
 
 
327 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.53 
 
 
327 aa  288  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.4 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.85 
 
 
332 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.91 
 
 
329 aa  285  8e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.75 
 
 
334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.75 
 
 
334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.19 
 
 
341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.15 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.25 
 
 
332 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.55 
 
 
328 aa  279  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.25 
 
 
332 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.74 
 
 
328 aa  275  9e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.53 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1615  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.16 
 
 
596 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.88 
 
 
327 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.37 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.88 
 
 
327 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  43.11 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.98 
 
 
346 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  42.22 
 
 
329 aa  248  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  40.82 
 
 
331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.11 
 
 
335 aa  238  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2577  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  42.81 
 
 
323 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.646455  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.05 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>