More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2766 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 
340 aa  707    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  48.22 
 
 
333 aa  333  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  38 
 
 
479 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 
363 aa  77  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  36.89 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  34.29 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  27.49 
 
 
491 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  34.29 
 
 
387 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  31.61 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 
491 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 
565 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  39.39 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
491 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
491 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
491 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
491 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.83 
 
 
491 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  38.61 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
491 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  33.64 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  32.23 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.8 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  38 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.95 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 
482 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.6 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.28 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  36.7 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.33 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  30 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.35 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.17 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.52 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.71 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1782  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.56 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A moaA1  27.65 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0851136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  35.92 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.41 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.95 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.68 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.36 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5965  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.69 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0233125 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  34.31 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1702  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.2 
 
 
375 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.475579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  31.91 
 
 
376 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 
393 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 
423 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3319  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  36.63 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.328193 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.41 
 
 
374 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 
423 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  36.19 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.42 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  36.63 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.97 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  34.31 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0883  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.98 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.83 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.35 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  31.82 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0217  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.5 
 
 
437 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.15 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.35 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6512  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.88 
 
 
405 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397453  normal  0.0847554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  35 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.63 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  33.64 
 
 
501 aa  65.1  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.85 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  40.2 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.81 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.82 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.33 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  25.09 
 
 
487 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  34.02 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.37 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  39 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.25 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.55 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.26 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.81 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.25 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 
394 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.25 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.24 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.347624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.97 
 
 
399 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1434  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.24 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.1 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.34 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>