More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0580 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  100 
 
 
513 aa  1062    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  45.07 
 
 
561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  45 
 
 
506 aa  438  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  43.58 
 
 
487 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  43.18 
 
 
495 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  43.54 
 
 
495 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  42.25 
 
 
489 aa  422  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  43.2 
 
 
491 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  42.3 
 
 
512 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 
472 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  38.7 
 
 
608 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  44.18 
 
 
496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  39.54 
 
 
609 aa  367  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  39.18 
 
 
578 aa  359  5e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  38.65 
 
 
573 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  38.39 
 
 
559 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  38.16 
 
 
573 aa  354  2e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  38.15 
 
 
579 aa  352  8e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 
569 aa  345  8e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  36.12 
 
 
581 aa  332  1e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  36.75 
 
 
582 aa  331  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  32.23 
 
 
706 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 
436 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  30.55 
 
 
447 aa  216  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 
471 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 
441 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  29.34 
 
 
459 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 
441 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 
727 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 
442 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 
445 aa  205  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 
453 aa  205  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 
530 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 
458 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 
492 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  29.7 
 
 
465 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.84 
 
 
464 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 
523 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 
471 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  35.35 
 
 
470 aa  186  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.51 
 
 
455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  27.7 
 
 
776 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 
481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  28.02 
 
 
486 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  27.31 
 
 
479 aa  173  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 
467 aa  170  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  27.73 
 
 
471 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 
463 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
519 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  26.46 
 
 
474 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  34.25 
 
 
543 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  32.89 
 
 
588 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  23.09 
 
 
514 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  23.09 
 
 
514 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  23.09 
 
 
514 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 
533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  34.05 
 
 
501 aa  84.3  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.06 
 
 
296 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  25.23 
 
 
333 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.39 
 
 
333 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 
565 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.6 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.63 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.13 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.44 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.48 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.07 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.68 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  26.02 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.88 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.12 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.06 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.12 
 
 
323 aa  67  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 
372 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
382 aa  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.12 
 
 
326 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.86 
 
 
327 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.58 
 
 
353 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.81 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 
427 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.58 
 
 
328 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.63 
 
 
326 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 
415 aa  65.1  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 
496 aa  65.1  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  28.34 
 
 
316 aa  64.7  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.12 
 
 
341 aa  63.9  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.75 
 
 
337 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 
377 aa  63.9  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.59 
 
 
333 aa  63.9  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>