More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0703 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
609 aa  1265    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  50.37 
 
 
581 aa  576  1.0000000000000001e-163  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  50.37 
 
 
582 aa  560  1e-158  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  48.95 
 
 
559 aa  560  1e-158  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  46.98 
 
 
489 aa  463  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  47.72 
 
 
491 aa  463  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  47.12 
 
 
487 aa  459  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  45.93 
 
 
495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  44.96 
 
 
506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  43.56 
 
 
495 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  42.24 
 
 
512 aa  431  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  42.97 
 
 
496 aa  419  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  48.45 
 
 
472 aa  422  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  41.43 
 
 
579 aa  402  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 
573 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  41.33 
 
 
578 aa  399  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 
573 aa  398  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  39.51 
 
 
569 aa  380  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  39.54 
 
 
513 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  36.33 
 
 
561 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 
608 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 
445 aa  252  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 
441 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 
492 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 
458 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  32.19 
 
 
470 aa  242  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 
727 aa  240  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  32.78 
 
 
471 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  32.78 
 
 
471 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 
442 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  31.35 
 
 
467 aa  226  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 
453 aa  225  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  31.66 
 
 
447 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  28.6 
 
 
706 aa  220  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  31.03 
 
 
459 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  32.02 
 
 
465 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  29.98 
 
 
530 aa  216  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 
523 aa  213  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.04 
 
 
464 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  28.87 
 
 
776 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  28.54 
 
 
436 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 
519 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  31.35 
 
 
441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 
463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
543 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.93 
 
 
455 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  28.43 
 
 
486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  27.18 
 
 
479 aa  165  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  26.5 
 
 
471 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  27.94 
 
 
474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  32.41 
 
 
588 aa  150  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
481 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  22.26 
 
 
533 aa  100  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  24.93 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 
349 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.82 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  27.41 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.69 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.79 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  36.36 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.26 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 
565 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
406 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 
398 aa  70.5  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.96 
 
 
329 aa  70.1  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.79 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.79 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.79 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.79 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.89 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.26 
 
 
337 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  31.32 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.59 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.97 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.79 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.58 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.73 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.93 
 
 
342 aa  67  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.26 
 
 
337 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.71 
 
 
317 aa  66.6  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 
333 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.82 
 
 
317 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.26 
 
 
337 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.04 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.86 
 
 
380 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.19 
 
 
356 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  30.86 
 
 
387 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.67 
 
 
399 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 
389 aa  66.2  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
427 aa  66.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.9 
 
 
333 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 
381 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>