More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1938 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 727 aa  1490    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  69.77 
 
 		 458 aa  625  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  53.59 
 
 		 464 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  51.56 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  49.48 
 
 		 492 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  50.11 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  50.11 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  51.1 
 
 		 465 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  50.68 
 
 		 470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  51.93 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  50.11 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  47.76 
 
 		 467 aa  432  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  42.53 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  42.4 
 
 		 588 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  43.9 
 
 		 519 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  49.33 
 
 		 543 aa  317  6e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 		 436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  38.37 
 
 		 472 aa  279  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  36.65 
 
 		 506 aa  276  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  34.96 
 
 		 489 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  33.4 
 
 		 496 aa  269  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  33.53 
 
 		 495 aa  267  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  35.55 
 
 		 441 aa  262  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  35.6 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 		 487 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  33.94 
 
 		 512 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  32.86 
 
 		 495 aa  254  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  32.42 
 
 		 561 aa  250  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  34.15 
 
 		 491 aa  248  4e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 569 aa  241  4e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 		 609 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  33.26 
 
 		 530 aa  230  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 		 579 aa  226  8e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 573 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 523 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  32.71 
 
 		 578 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  33.33 
 
 		 455 aa  219  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 608 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 573 aa  217  5e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  31.61 
 
 		 479 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  41.22 
 
 		 1005 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  31.92 
 
 		 474 aa  213  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  31.39 
 
 		 776 aa  212  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 581 aa  211  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 513 aa  207  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  29.7 
 
 		 582 aa  207  6e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  42.97 
 
 		 1002 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 481 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  41.37 
 
 		 1039 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 559 aa  190  8e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  29.51 
 
 		 486 aa  188  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  31.78 
 
 		 471 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  43.81 
 
 		 1000 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  35.99 
 
 		 1014 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4167  SAM-dependent methyltransferase  35.09 
 
 		 279 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30219  normal  0.258943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1930  SAM-dependent methyltransferases  35.38 
 
 		 278 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.313552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 533 aa  132  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2638  hypothetical protein  31.25 
 
 		 208 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.642066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1999  hypothetical protein  30.84 
 
 		 237 aa  124  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  30.55 
 
 		 514 aa  124  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  30.55 
 
 		 514 aa  124  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  30.55 
 
 		 514 aa  124  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05240  hypothetical protein  28.95 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  29.17 
 
 		 706 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0035  hypothetical protein  32.95 
 
 		 223 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1619  hypothetical protein  28.36 
 
 		 234 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3260  SAM-dependent methyltransferase  35.93 
 
 		 245 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.15 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.15 
 
 		 337 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.07 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.07 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.07 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.89 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.07 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.25 
 
 		 317 aa  79.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.92 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 427 aa  76.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.32 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.64 
 
 		 327 aa  76.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.51 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  28.62 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.32 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.53 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.5 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.32 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 		 356 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.37 
 
 		 399 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.26 
 
 		 356 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.14 
 
 		 327 aa  73.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.35 
 
 		 318 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.17 
 
 		 325 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.97 
 
 		 333 aa  73.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.19 
 
 		 298 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 306 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>